査読付き論文

1 Koki Hara, Shunji Yamada, Eisuke Chikayama, and Jun Kikuchi, "Parameter Visualization of Benchtop Nuclear Magnetic Resonance Spectra toward Food Process Monitoring", Processes 10, 1264(2022)

2 Koki Hara, ShunjiYamada, Atsushi Kurotani, Eisuke Chikayama, and Jun Kikuchi, "Materials informatics approach using domain modelling for exploring structure?property relationships of polymers", Scientific Reports 12, 10558(2022)

3 Shunji Yamada, Eisuke Chikayama, and Jun Kikuchi, "Signal Deconvolution and Generative Topographic Mapping Regression for Solid-State NMR of Multi-Component Materials", International Journal of Molecular Sciences 22, 1086(2021)

4 S. Yamada, A. Kurotani, E. Chikayama, and J. Kikuchi, "Signal Deconvolution and Noise Factor Analysis Based on a Combination of Time-Frequency Analysis and Probabilistic Sparse Matrix Factorization", International Journal of Molecular Sciences 21, 2978(2020)

5 Shunji Yamada, Kengo Ito, Atsushi Kurotani, Yutaka Yamada, Eisuke Chikayama, and Jun Kikuchi, "InterSpin: Integrated Supportive Webtools for Low- and High-Field NMR Analyses Toward Molecular Complexity", ACS Omega 4, 3361-3369(2019)

6 Kengo Ito, Yuka Obuchi, Eisuke Chikayama, Yasuhiro Date, and Jun Kikuchi, "Exploratory machine-learned theoretical chemical shifts can closely predict metabolic mixture signals", Chemical Science 9, 8213-8220(2018)

7 S. Tomita, S. Ikeda, S. Tsuda, N. Someya, K. Asano, J. Kikuchi, E. Chikayama, H. Ono, Y. Sekiyama, "A survey of metabolic changes in potato leaves by NMR-based metabolic profiling in relation to resistance to late blight disease under field conditions", Magnetic Resonance in Chemistry 55, 120-127(2017)

8 Eisuke Chikayama, Ryo Yamashina, Keiko Komatsu, Yuuri Tsuboi, Kenji Sakata, Jun Kikuchi, Yasuyo Sekiyama, "FoodPro: A Web-Based Tool for Evaluating Covariance and Correlation NMR Spectra Associated with Food Processes", Metabolites 6, 36(2016)

9 Eisuke Chikayama, Yudai Shimbo, Keiko Komatsu, Jun Kikuchi, "The Effect of Molecular Conformation on the Accuracy of Theoretical 1H and 13C Chemical Shifts Calculated by Ab Initio Methods for Metabolic Mixture Analysis", Journal of Physical Chemistry B 120, 3479-3487(2016)

10 J. Kikuchi, Y. Tsuboi, K. Komatsu, M. Gomi, E. Chikayama, Y. Date, "SpinCouple: Development of a Web Tool for Analyzing Metabolite Mixtures via Two-Dimensional J-Resolved NMR Database", Analytical Chemistry 88, 659-665(2016)

11 E. Chikayama, "Decomposition of multivariate function using the Heaviside step function", SpringerPlus 3, 704(2014)

12 E. Chikayama, Y. Sunaga, S. Noda, H. Yokota, "Solvable model for chemical oscillations", Journal of Mathematical Chemistry 52, 399-406(2014)

13 K. Shirai, Y. Amano, S. Omatu, E. Chikayama, "POWER-LAW DISTRIBUTION OF RATE-OF-RETURN DEVIATION AND EVALUATION OF CASH FLOW IN A CONTROL EQUIPMENT MANUFACTURING COMPANY", International Journal of Innovative Computing, Information and Control 9, 1095-1112(2013)

14 T. Mori, E. Chikayama, Y. Tsuboi, N. Ishida, N. Shisa, Y. Noritake, S. Moriya, J. Kikuchi, "Exploring the conformational space of amorphous cellulose using NMR chemical shifts", Carbohydrate Polymers 90, 1197?1203(2012)

15 K. Okushita, T. Komatsu, E. Chikayama and J. Kikuchi, "Statistical approach for solid-state NMR spectra of cellulose derived from a series of variable parameters", Polymer Journal 44, 895-900(2012)

16 K. Okushita, E. Chikayama, J. Kikuchi, "Solubilization Mechanism and Characterization of the Structural Change of Bacterial Cellulose in Regenerated States through Ionic Liquid Treatment", Biomacromolecules 13, 1323-1330(2012)

17 Y. Ogata, E. Chikayama, Y. Morioka, R. C. Everroad, A. Shino, A. Matsushima, H. Haruna, S. Moriya, T. Toyoda, J. Kikuchi, "ECOMICS: A Web-Based Toolkit for Investigating the Biomolecular Web in Ecosystems Using a Trans-omics Approach", PLoS ONE 7, e30263(2012)

18 Y. Nakanishi, S. Fukuda, E. Chikayama, Y. Kimura, H. Ohno, J. Kikuchi, "Dynamic Omics Approach Identifies Nutrition-Mediated Microbial Interactions", Journal of Proteome Research 10, 824-836(2011)

19 Y. Sekiyama, E. Chikayama, J. Kikuchi, "Evaluation of a Semipolar Solvent System as a Step toward Heteronuclear Multidimensional NMR-Based Metabolomics for (13)C-Labeled Bacteria, Plants, and Animals", Analytical Chemistry 83, 719-726(2011)

20 E. Chikayama, A. Kurotani, T. Tanaka, T. Yabuki, S. Miyazaki, S. Yokoyama, Y. Kuroda, "Mathematical model for empirically optimizing large scale production of soluble protein domains", BMC Bioinformatics 11, 113(2010)

21 E. Chikayama, Y. Sekiyama, M. Okamoto, Y. Nakanishi, Y. Tsuboi, K. Akiyama, K. Saito, K. Shinozaki, J. Kikuchi, "Statistical indices for simultaneous large-scale metabolite detections for a single NMR spectrum", Analytical Chemistry 82, 1653-1658(2010)

22 Y. Sekiyama, E. Chikayama, J. Kikuchi, "Profiling polar and semipolar plant metabolites throughout extraction processes using a combined solution-state and high-resolution magic angle spinning NMR approach", Analytical Chemistry 82, 1643-1652(2010)

23 M. Okamoto, Y. Tsuboi, E. Chikayama, J. Kikuchi, T. Hirayama, "Metabolic movement upon abscisic acid and salicylic acid combined treatments", Plant Biotechnology 26, 551-560(2009)

24 S. Fukuda, Y. Nakanishi, E. Chikayama, H. Ohno, T. Hino, J. Kikuchi, "Evaluation and characterization of bacterial metabolic dynamics with a novel profiling technique, real-time metabolotyping", PLoS ONE 4, e4893(2009)

25 E. Chikayama, M. Suto, T. Nishihara, K. Shinozaki, J. Kikuchi, "Systematic NMR analysis of stable isotope labeled metabolite mixtures in plant and animal systems: coarse grained views of metabolic pathways", PLoS ONE 3, e3805(2008)

26 K. Akiyama, E. Chikayama, H. Yuasa, Y. Shimada, T. Tohge, K. Shinozaki, M. Y. Hirai, T. Sakurai, J. Kikuchi, K. Saito, "PRIMe: a Web site that assembles tools for metabolomics and transcriptomics", In Silico Biology 8, 339-345(2008)

27 C. Tian, E. Chikayama, Y. Tsuboi, T. Kuromori, K. Shinozaki, J. Kikuchi, T. Hirayama, "Top-down phenomics of Arabidopsis thaliana: metabolic profiling by one- and two-dimensional nuclear magnetic resonance spectroscopy and transcriptome analysis of albino mutants", The Journal of Biological Chemistry 282, 18532?18541(2007)

28 E. Chikayama, A. Kurotani, Y. Kuroda, S. Yokoyama, "ProteoMix: an integrated and flexible system for interactively analyzing large numbers of protein sequences", Bioinformatics 20, 2836-2838(2004)

総説

1. E. Chikayama and S. Chikayama, "Transcendental Numbers in Wonderland", Math Horizons 24, 22(2017)

2. 関山恭代, 近山英輔, 菊地 淳, "NMR 計測による生体代謝物情報の抽出", ぶんせき , 81-88(2012)

3. 篠阿弥宇, 近山英輔, 菊地淳, "リグノセルロースNMR解析技術の世界動向と将来展望", ケミカルエンジニヤリング 56, 608-613(2011)

4. 黒田裕, 近山英輔, 横山茂之, "構造解析のターゲット選択", 蛋白質核酸酵素 46, 2066-2072(2001)

著書

1. 近山英輔, 赤木謙一, 菊地淳, "NMRメタボロミクス解析ソフトウエア", 遺伝子医学MOOK16 メタボロミクス:その解析技術と臨床・創薬応用研究の最前線, メディカルドゥ(2010)

招待講演

関山恭代, 近山英輔(本人発表) “多次元NMR法による植物メタボローム解析” 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会, 横浜, 2007 12月12日

近山英輔 “プロテオーム解析のための多ドメインタンパク質の分割”, 産総研生命情報科学人材養成コース第18回生命情報科学特別講義, 東京, 2003年10月31日

学会発表(国際会議)

Stephan J. Ginthor, Matthias Bechmann, Maria Theresia Zich, Eisuke Chikayama, Norbert Mueller, "Towards 2D RASER-detected NMR", 61th ENC Conference, Baltimore, USA, 3/8-13, 2020

Shunji Yamada, Atsushi Kurotani, Yutaka Yamada, Eisuke Chikayama, Jun Kikuchi, "InterSpin: Database and webtool for small to macromolecular mixture analysis", EUROMAR2017, Warsaw, Poland, 7/2-6, 2017

R. Yamashina, E. Chikayama, K. Komatsu, Y. Tsuboi, K. Sakata, Y. Sekiyama, M. Kameyama, and J. Kikuchi, "FoodPro: Web Tool for Evaluation of Food Processing Based on Spectral Pattern from Benchtop NMR", The 27th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems, Kyoto, Japan, 8/21-26, 2016

Satoru Tomita, Kenji Asano, Seishi Ikeda, Jun Kikuchi, Eisuke Chikayama, Hirohshi Ono, Akira Kobayashi, Yuki Kobayashi, Yasuyo Sekiyama, "NMR-based metabolic profiling of potato leaves for identification of potential metabolic indicators in relation to common scab of potato tubers", METABOLOMICS 2015, San Francisco, USA, 6/29-2, 2015

Yasuyo Sekiyama, S. Ikeda, S. Tsuda, N. Someya, Eisuke Chikayama, Jun Kikuchi, and Hiroshi Ono, "NMR-based metabolite profiling in potato and rice plants", METABOLOMICS 2012, Washington, DC, USA, 6/25-28, 2012

Keiko Okushita, Tomohiro iikura, Yasuhiro Date, Yoshiyuki Ogata, Eisuke Chikayama, and Jun Kikuchi, "Evaluation of cellulose degradation properties in microbial ecosystem by solution and solid-state NMR", ISNMR 2011, Yokohama, Japan, 11/15-18, 2011

Tamotsu Kato, Shinji Fukuda, Yasuhiro Date, Eisuke Chikayama, Yumiko Nakanishi, Yuuri Tsuboi, Satoshi Tsuneda, Shigeharu Moriya, Jun Kikuchi, and Hiroshi Ohno, "Evaluation of gut environmental dynamics based on gene expression profiling", 2nd TNO Beneficial Microbes Conference, Noordwijkerhout, the Netherlands, 3/15-17, 2010

Yasuyo Sekiyama, Eisuke Chikayama, and Jun Kikuchi, "Evaluation of extraction solvents for comparative metabolome analysis and profiling plant metabolites throughout extraction processes using two-dimensional 1H-13C NMR spectra", The 5th International Conference of the Metabolomics Society, Alberta, Canada, 8/30-2, 2009

Yumiko Nakanishi, Shinji Fukuda, Eisuke Chikayama, Yayoi Kimura, Hiroshi Ohno, and Jun Kikuchi, "Exchange of nutrients in bacterial cross-talk identified by a novel metabolic monitoring system", The 5th International Conference of the Metabolomics Society, Alberta, Canada, 8/30-2, 2009

Eisuke Chikayama, Mami Okamoto, Yuuri Tsuboi, Kazuki Saito, and Jun Kikuchi, "Towards comprehensive metabolite identification by NMR-based methods in plant metabolomics", , Tokyo, Japan, 7/15-18, 2008

Yasuyo Sekiyama, Kenji Akamine, Eisuke Chikayama, Takashi Hirayama, Kazuki Saito, and Jun Kikuchi " Methodological advances in hetero-nuclear NMR-based metabolomics and its application to the metabolic flux analysis in Oryza sativa" 5th International Conference on Plant Metabolomics (ICPM2008), Tokyo, Japan, July 15th-18th 2008

E. Chikayama, M. Okamoto, Y. Nakanishi, T. Hirayama, K. Saito, and J. Kikuchi "Multidimensional NMR-based Metabolomics with SpinAssign: Metabolite Identification in NMR Spectra of Crude Extracts using a Robust Metabolite Chemical Shift Database" Third Scientific Meeting of the Metabolomics Society (Metabolomics 2007), Manchester, UK, June 11th-14th 2007

Y. Tsuboi, S. Fukuda, H. Ohno, J. Kikuchi, T. Hirayama, and E. Chikayama "Food changes anything - Following 13C-metabolic changes from plants to animals and dietary effect on gut microbiota in mouse" Third Scientific Meeting of the Metabolomics Society (Metabolomics 2007), Manchester, UK, June 11th-14th 2007

T. Hirayama, C. Tian, Y. Tsuboi, E. Chikayama, Y. Sekiyama, T. Kuromori, K. Shinozaki, J. Kikuchi "Advances in hetero-nuclear NMR-based metabolomics approach in plant systems" Plant Biology 2006: Joint Annual Meeting of the American Society of Plant Biologists and the Canadian Society of Plant Physiologists,Boston, USA, Aug 2006

J. Kikuchi, E. Chikayama, Y. Tsuboi, Y. Nakanishi, M. Okamoto, K. Shinozaki, T. Hirayama "Metabolic profiling and molecular identifications of stable isotope labeled plant, animal and bacterial systems" 22th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems, Gottingen, Germany, Aug 2006

J. Kikuchi, E. Chikayama, M. Izumikawa, C. Tian, Y. Tsuboi, K. Saito, K. Shinozaki, T. Hirayama "From 1D to nD-NMR : Technical advantage for novel metabolic profiling, efficient molecular identification and application to chemical biology research" 2nd Scientific Meeting of The Metabolomics Society (Metabolomics 2006), Boston, USA, Jun 2006

C. Tian, Y. Tsuboi, E. Chikayama, Y. Sekiyama, T. Kuromori, K. Shinozaki, T. Hirayama, J. Kikuchi "An efficient strategy for the metabolic characterization of Arabidopsis mutants with visible and silent phenotypes by fast 1D-NMRscreening followed by multi-dimensional NMR analysis" Second Scientific Meeting of the Metabolomics Society (Metabolomics 2006), Boston, USA, Jun 2006

J. Kikuchi, Y. Sekiyama, E. Chikayama, M. Izumikawa, Y. Tsuboi, K. Saito, K. Shinozaki, T. Hirayama "Methodological advancements for efficient molecular identification and reaction analysis for a hetero-nuclear NMR-based metabomics" 20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress, Kyoto, Japan, Jun 2006

T. Hirayama, C. Tian, Y. Tsuboi, E. Chikayama, Y. Sekiyama, T. Kuromori, K. Shinozaki, J. Kikuchi "Advances in hetero-nuclear NMR based metabolomics approach in plant systems" 20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress, Kyoto, Japan, Jun 2006

E. Chikayama, Y. Sekiyama, T. Hirayama, K. Saito, K. Shinozaki, and J. Kikuchi “SpinAssign : an Integrated Spectrum Analysis System for a Hetero-nuclear NMR-based Metabomics” 47th ENC Conference, Pacific Grove, USA, Apr 2006

J. Kikuchi, Y. Sekiyama, E. Chikayama, Y. Tsuboi, K. Saito, K. Shinozaki, T. Hirayama "Molecular structure analysis and its metabolic flow measurements at atomic level by a hetero-nuclear NMR" 4th International Plant Metabolomics Conference, Reading, UK, Apr 2006

Y. Sekiyama, E. Chikayama, T. Hirayama, K. Saito, K. Shinozaki, and J. Kikuchi “Methodological advances of hetero-nuclear NMR-based metabolomics by uniform stable isotope labeling into Arabidopsis thaliana” The 1st Asia-Pacific NMR Symposium, Yokohama, Japan, Nov 2005

E. Chikayama, Y. Sekiyama, T. Hirayama, K. Saito, K. Shinozaki, and J. Kikuchi “Toward highly efficient molecular identification algorithm in a heteronuclear NMR-based metabomics” The 1st Asia-Pacific NMR Symposium, Yokohama, Japan, Nov 2005

E. Chikayama, Y. Sekiyama, K. Shinozaki, K. Saito, and J. Kikuchi “A novel method for metabolic profiling of hetero-nuclear NMR spectra based on pattern recognition algorithm” First Scientific Meeting of the Metabolomics Society (Metabolomics 2005), Tsuruoka, Japan, Jun 2005

T. Yabuki, E. Seki, Y. Fujikura, M. Inoue, M. Aoki, Y. Tomo, E. Chikayama, A. Tanaka, T. Kigawa and S. Yokoyama “Experiment Information Management System for Highthroughput Protein Synthesis and Screening” The 3rd International Conference on Structural Genomics (ICSG 2004), Washington, DC, US, 2004

A. Kurotani, E. Chikayama, Y. Kuroda and S. Yokoyama “ProteoMix: An integrated system for interactively analyzing and annotating proteomes” The 1st Pacific-Rim International Conference on Protein Science (PRICPS 2004), Yokohama, Japan, Apr 2004

T. Hondoh, Y. Kuroda, E. Chikayama, S. Kuramitsu, T. Shibata, Y .Inoue and S. Yokoyama “Identification of folded protein domain candidates for high-throughput structure determination” Canada-UK-Japan Joint Symposium on Toward Post DNA-Sequencing Era, Yokohama, Japan, FEB 2002

E. Chikayama, Y. Kuroda, K. Tani, Y. Matsuo, J. Kawai, Y. Hayashizaki and S. Yokoyama “Automated protein domain prediction system for the selection of structure determination targets” The 1st International Conference on Structural Genomics (ICSG 2000), Yokohama, Japan, Nov 2nd-5th 2000

学会発表(国内会議)

山田隼嗣, 近山英輔, 菊地淳, "高分子材料を対象としたT2*緩和に基づく固体NMR信号分離法の開発", 第59回NMR討論会, 高崎, 2020年11月

山田隼嗣, 黒谷篤之, 近山英輔, 菊地 淳, "山積されるNMR情報のデータクレンジング法検討およびツール開発", 日本農芸化学会2019大会, 東京, 2019年3月

山田隼嗣, 黒谷篤之, 近山英輔, 菊地 淳, "山積されるNMR情報のデータクレンジング法検討およびツール開発", 第57回NMR討論会, 札幌, 2018年9月

山田隼嗣, 伊藤研悟, 黒谷篤之, 山田 豊, 近山英輔, 菊地 淳, "高・低分子混合物の NMR シグナル帰属能向上を目指したInterSpin ツール開発", 日本農芸化学会2018大会, 名古屋, 2018年3月

伊藤研悟,尾渕由佳,近山英輔,伊達康博,菊地淳, "量子化学計算と機械学習を用いた化学シフト予測法の高度化", 第56回NMR討論会, 東京, 2017年11月

山田隼嗣,伊藤研悟,黒谷篤之,山田豊,近山英輔,菊地淳, "統合ウェブツールInterSpinの開発に基づく混合物の高・低磁場NMRスペクトル解析", 第56回NMR討論会, 東京, 2017年11月

近山英輔,山科椋,小松桂子,坪井裕理,坂田研二,関山恭代,亀山真由美,菊地淳, "卓上および高磁場NMR装置を利用した食品加工過程の分析評価情報ツール開発", 第54回NMR討論会, 習志野, 2015年11月

Chikara Sawa, Masakazu Tanaka, Hayato Takeuchi, Kiminori Toyooka, Eisuke Chikayama, "Evaluation of higher order and high resolution schemes for 3D cell simulation"(3次元細胞シミュレーションにおける高次精度・高解像度スキームの評価), 日本生物物理学会第53回年会, 金沢, 2015年9月

中山超, 坪井裕理, 伊達康博, 近山 英輔, 菊地 淳, "代謝混合物の2D-J NMRデータの解析webツールの開発と量子化学計算による帰属支援", 日本農芸化学会2015, 岡山, 2015年3月

中山超、近山英輔、伊達康博、菊地淳, "代謝混合物のシグナル分離に有用な2D-J NMRデータの解析支援webツールの開発", 第66回日本生物工学会大会, 札幌, 2014年9月

近山英輔, "非線形関数のステップ関数表示の公式", 日本生物物理学会第51回年会, 京都, 2013年10月

関山 恭代, 池田 成志, 津田 昌吾, 染谷 信孝, 近山 英輔, 菊地 淳, 小野 裕嗣, "NMRメタボロミクスによるジャガイモ疫病抵抗性マーカーの探索", 日本農芸化学会2013大会, 仙台, 2013年3月

近山英輔, "Hill式による非線形自励力学系の近似計算", 日本生物物理学会第50回年会, 名古屋, 2012年9月

近山英輔, "連続体のパターン選択を考慮した運動方程式の近似表現", 日本生物物理学会第49回年会, 姫路, 2011年9月

近山英輔, "連続体力学における生化学パターンの考察", バイオスーパーコンピューティングサマースクール2011, 淡路, 2011年9月

福田真嗣,伊達康博,加藤 完,中西裕美子,近山英輔,坪井裕理,常田 聡,守屋繁春,菊地 淳,大野博司 “複合オミックス解析による腸内環境評価系の構築” 第13回腸内細菌学会、東京、2009年6月11日~12日

加藤完, 伊達康博, 福田真嗣, 中西裕美子, 近山英輔, 坪井裕理, 常田聡, 守屋繁春, 菊地淳, 大野博司 "バクテリア発現遺伝子情報を付与したDGGE-NMR 相関解析法による腸内環境評価系の構築" 第31回日本分子生物学会年会-第81回日本生化学会大会合同大会、神戸、2008年12月9日~12日

黒田裕, 近山英輔 ”A Mathematical Model for Optimizing Protein Dissection in High Throughput Proteomics Research” 第46回日本生物物理学会年会, 福岡, 2008年12月3日~5日

近山英輔、春名英明、菊地淳 "代謝物同定システムSpinAssignを用いた網羅的メタボローム計測へ向けた戦略" 第46回NMR討論会, つくば, 2008年11月12日~14日

菊地淳, 近山英輔, 須藤倫崇, 古田拓, 持田恵一 "生命の環境調和システムへの異種相関解析の試み" 第46回NMR討論会, つくば, 2008年11月12日~14日

春名英明、近山英輔、菊地淳 "部分構造検索を用いたHSQCシグナルからの構造予測法の開発" 第46回NMR討論会, つくば, 2008年11月12日~14日

中西裕美子, 縫島裕美, 伊達康博, 加藤完, 福田真嗣, 近山英輔, 大野博司, 菊地淳 "機能性食品摂取による腸内環境変動の評価法のための技術開発" 第46回NMR討論会, つくば, 2008年11月12日~14日

伊達 康博, 福田 真嗣, 中西 裕美子, 近山 英輔, 坪井 裕理, 常田 聡, 大野 博司, 菊地 淳 “微生物叢-代謝物群相関解析(DGGE-NMR) 法による腸内環境変動の評価法構築” 第60回 日本生物工学会大会, 仙台, 2008年8月27日~29日

近山英輔, 岡本真美, 関山恭代, 平山隆志, 斉藤和季, 菊地 淳 ”多次元NMRと代謝物ケミカルシフトデータベースを用いたメタボローム一斉解析法の構築” 第45回日本生物物理学会年会, 横浜, 2007年12月21日

中西裕美子, 福田真嗣, 近山英輔, 木村悠一, 大野博司, 菊地淳 "腸内細菌群のニュートリメタボノミクス基盤技術の構築" 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会, 横浜, 2007年12月

近山英輔, 関山恭代, 坪井裕理, 中西裕美子, 岡本真美, 斉藤和季, 菊地淳 "代謝物ケミカルシフトデータベースとNMRメタボロミクス用ソフトウエアSpinAssignを用いた代謝物同定" 第2回メタボロームシンポジウム, 東京, 2007年11月

中西裕美子, 福田真嗣, 近山英輔, 木村悠一, 大野博司, 菊地淳 "腸内細菌に着目したニュートリメタボノミクス基盤技術の構築" 第2回メタボロームシンポジウム, 東京, 2007年11月

春名英明, 近山英輔, 大野博司, 菊地淳 "NMRメタボミクス解析ソフトウエアSpinAssignの高性能化の試み" 第2回メタボロームシンポジウム, 東京, 2007年11月

関山恭代, 近山英輔, 平山隆志, 斉藤和季, 菊地 淳 ”安定同位体標識および多次元NMR法による、代謝物一斉解析法の開発と植物代謝動態解析の検討” 第49回天然有機化合物討論会, 札幌, 2007年9月19日

近山英輔, 菊地淳 “新しいNMR分光法:時間周波数NMR分光法の試み” 第46回NMR討論会, 札幌, 2007年9月

中西裕美子, 福田真嗣, 近山英輔, 木村悠一, 大野博司, 菊地淳 “NMR計測を用いた栄養源変化に対する腸内細菌の代謝動態解析” 第46回NMR討論会, 札幌, 2007年9月

秋山顕治,近山英輔,菊地淳,嶋田幸久,湯浅裕亮,大林武,真保陽子,峠隆之,平井優美,金谷重彦,篠崎一雄,斉藤和季,櫻井哲也 “PRIMe; トランスクリプトーム/メタボロームゲートウェイの開発とその進捗” 日本分子生物学会2006フォーラム, 名古屋, 2006年12月

近山英輔, 平山隆志, 篠崎一雄, 菊地淳 ”SpinAssign: 多次元NMRメタボミクスのためのコンピューター支援スペクトル解析システム” 第45回NMR討論会, 京都, 2006年11月

Chunjie Tian, Yuri Tsuboi, Eisuke Chikayama, Yasuyo Sekiyama, Takashi Kuromori, Kazuo Shinozaki, Jun Kikuchi and Takashi Hirayama “An efficient strategy for the screening and characterization of Arabidopsis mutants with visible phenotypes by one- and multi-dimensional NMR spectra analysis” 第45回NMR討論会, 京都, 2006年11月

菊地淳, 関山恭代, 近山英輔, 福田真嗣, 中西裕美子, 坪井裕理, 斉藤和季, 篠崎一雄, 平山隆志 "NMR法の特性を生かしたメタボローム基盤技術の開発" 日本農芸化学会大会, 京都, 2006年3月

関山恭代, 近山英輔, 平山隆志, 篠崎一雄, 斉藤和季, 菊地淳 "安定同位体標識化による多次元NMRメタボローム解析法の開発と代謝動態析の検討" 日本農芸化学会大会, 京都, 2006年3月

田春杰, 坪井裕理, 近山英輔, 関山恭代, 黒森崇, 篠崎一雄, 平山隆志, 菊地淳 “多次元NMRメタボロミクスの基盤整備と植物代謝物解析への応用” 第47回日本植物生理学会年会, つくば, 2006年3月

菊地淳,関山恭代,近山英輔,坪井裕理,斉藤和季,篠崎一雄,平山隆志 “動植物個体均一安定同位体標識化による生細胞・抽出物の多次元NMR計測技術高度化の試み“ 第47回天然有機化合物討論会,徳島,2005年10月

鎌足雄司, 斉藤講平, 泉顕也, 金野大助, 中村安里, 阿部孝政, 清宮恭子, 葛西卓磨, 栃尾尚哉, 近山英輔, 小柴生造, 林文晶, 廣田洋, 好田真由美, 井上真, 矢吹孝, 青木雅昭, 関英子, 寺田貴帆, 白水美香子, 田仲昭子, 小原収, 菅野純夫, 関原明, 篠崎一雄, 林崎良英, 川井悟, 木川隆則, 横山茂之 ”ホメオタンパク質に含まれる共通ドメインホメオボックスの分類と代表構造の決定” 第42回日本生物物理学会年会,京都,2004年12月

鎌足雄司, 斉藤講平, 泉顕也, 金野大助, 中村安里, 阿部孝政, 清宮恭子, 葛西卓磨, 栃尾尚哉, 近山英輔, 小柴生造, 林文晶, 廣田洋, 好田真由美, 井上真, 矢吹孝, 青木雅昭, 鞆康子, 関英子, 寺田貴帆, 白水美香子, 田仲昭子, 小原収, 菅野純夫, 関原明, 篠崎一雄, 林崎良英, 川井悟, 木川隆則, 横山茂之 “ホメオタンパク質に含まれる共通ドメインホメオボックスの分類と代表構造の決定” 第27回日本分子生物学会年会,神戸,2004年12月

近山英輔, 黒谷篤之, 黒田裕, 横山茂之 “構造プロテオミクスのためのタンパク質ドメイン同定システム:ProteoMix “ 第46回日本神経化学会年会・第41回日本生物物理学会合同年会,新潟,2003年9月

近山英輔, 宮崎哲, 黒田裕, 横山茂之 “タンパク質アミノ酸残基対相関の構造依存性とparallel-antiparallel 2状態格子モデルによるMonte Carloシミュレーション“ 第39回日本生物物理学会年会,大阪,2001年10月

近山英輔, 三木洋一郎, 曽田邦嗣 “非極性溶質の溶解熱力学量に対する水溶媒分子の寄与” 第34回日本生物物理学会年会,つくば,1996年11月

近山英輔, ロジ・イスマイル・エコプライトノ, 三木洋一郎, 曽田邦嗣 “疎水水和における溶媒排除効果と溶質・水和水空間相関” 第33回日本生物物理学会年会,北海道,1995年9月

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